Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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