Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek9Q8K1R7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Nek9Q8K1R7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms