Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sde2Q8K1J5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms