Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Snrnp27Q8K194 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Snrnp27Q8K194 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Snrnp27Q8K194 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Snrnp27Q8K194 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Snrnp27Q8K194 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Snrnp27Q8K194 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp27Q8K194 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Snrnp27Q8K194 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Snrnp27Q8K194 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Snrnp27Q8K194 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Snrnp27Q8K194 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Snrnp27Q8K194 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Snrnp27Q8K194 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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