Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cog3Q8CI04 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cog3Q8CI04 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms