Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHY7

Ttc23, Tetratricopeptide repeat protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc23Q8CHY7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc23Q8CHY7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms