Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms