Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pramef8Q8CE24 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pramef8Q8CE24 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pramef8Q8CE24 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pramef8Q8CE24 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef8Q8CE24 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pramef8Q8CE24 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pramef8Q8CE24 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pramef8Q8CE24 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pramef8Q8CE24 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef8Q8CE24 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pramef8Q8CE24 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms