Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc63Q8CDV6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms