Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms