Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms