Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cwc22Q8C5N3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc22Q8C5N3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms