Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc90bQ8C3X2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc90bQ8C3X2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms