Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hdac7Q8C2B3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms