Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms