Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms