Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cxcl16Q8BSU2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cxcl16Q8BSU2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cxcl16Q8BSU2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cxcl16Q8BSU2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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