Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms