Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy4Q8BQ47 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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