Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prox2Q8BII1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms