Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
U2af1l4Q8BGJ9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms