Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4bQ8BGE6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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