Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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