Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms