Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TnnQ80Z71 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TnnQ80Z71 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms