Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms