Protein–RNA interactions for Protein: Q80W71

Plekha8, Pleckstrin homology domain-containing family A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekha8Q80W71 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plekha8Q80W71 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plekha8Q80W71 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms