Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmcc2Q80W04 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms