Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms