Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp8Q80U87 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms