Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccp110Q7TSH4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccp110Q7TSH4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms