Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms