Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sbno2Q7TNB8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sbno2Q7TNB8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sbno2Q7TNB8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sbno2Q7TNB8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sbno2Q7TNB8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sbno2Q7TNB8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sbno2Q7TNB8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sbno2Q7TNB8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sbno2Q7TNB8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sbno2Q7TNB8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sbno2Q7TNB8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sbno2Q7TNB8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sbno2Q7TNB8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sbno2Q7TNB8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sbno2Q7TNB8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sbno2Q7TNB8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms