Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shq1Q7TMX5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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