Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms