Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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