Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rph3alQ768S4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rph3alQ768S4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms