Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SpopQ6ZWS8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms