Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup188Q6ZQH8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup188Q6ZQH8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms