Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms