Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms