Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PdgfrlQ6PE55 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PdgfrlQ6PE55 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PdgfrlQ6PE55 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PdgfrlQ6PE55 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PdgfrlQ6PE55 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PdgfrlQ6PE55 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PdgfrlQ6PE55 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PdgfrlQ6PE55 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PdgfrlQ6PE55 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PdgfrlQ6PE55 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrlQ6PE55 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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