Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtminQ6P9S1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms