Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Podnl1Q6P3Y9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Podnl1Q6P3Y9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Podnl1Q6P3Y9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Podnl1Q6P3Y9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Podnl1Q6P3Y9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Podnl1Q6P3Y9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms