Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A8

Bckdhb, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhbQ6P3A8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms