Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrig3Q6P1C6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrig3Q6P1C6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms