Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pdcd11Q6NS46 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms