Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh1Q6IUP1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms