Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms