Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm4Q6IRU2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm4Q6IRU2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm4Q6IRU2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm4Q6IRU2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tpm4Q6IRU2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Tpm4Q6IRU2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm4Q6IRU2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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